Disciplina Bioinformática

O crescimento rápido da rede internet fornece à informação um território de expansão que facilita também a difusão das ferramentas informáticas. Serão apresentados os bancos de dados bioinformáticos e os programas disponíveis para o seu tratamento. Os princípios teóricos (biológicos e matemáticos) sobre os quais estes tratamentos são baseados serão igualmente abordados.

1. Introdução à Bioinformática.

Definição. Evolução e árvore filogenética do mundo vivo. Macromoléculas e informática. Principais organizações de Bioinformática.

2. Bases de dados.

Aspectos técnicos. Bases de dados principais.

3. Análise e comparação de sequências.

Modelos de substituição de nucleótidos. Similaridade entre sequências. Métodos de comparação de sequências e distância evolutiva. Alinhamentos de sequências. Programas e noções de base.

4. Análise filogenética.

Modelos de árvores filogenéticas. Métodos de construção de árvores. Testes estatísticos (Bootstrap) e programas.

5. Análise estrutural de macromoléculas.

Evolução das proteínas. Previsão das estruturas. Classificação das proteínas. Determinação da estrutura das biomoléculas. Recursos e programas.

6. Genomas, proteomas, transcriptomas.

Genomas (sequenciação, anotação, comparação, farmacogenética). Proteomas (electroforese bidimensional, espectrometria de massa). Transcriptomas (microarrays).

O carácter essencialmente prático desta UC destina-se a desenvolver no estudante um saber fazer indispensável na sua futura carreira.

- Graur D. & Li W.-H. (2000). Fundamentals of molecular evolution. Sinauer, Sunderland.

- Voet D. & Voet. J.G. (2010). Biochemistry, 4^th Ed. John Wiley & Sons, New York.