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Disciplina Métodos Computacionais em Biologia

  • Apresentação

    Apresentação

    O crescimento rápido da rede internet fornece à informação um território de expansão que facilita também a difusão das ferramentas informáticas. Serão apresentados os bancos de dados bioinformáticos e os programas disponíveis para o seu tratamento. Os princípios teóricos (biológicos e matemáticos) sobre os quais estes tratamentos são baseados serão igualmente abordados.
  • Conteúdos Programáticos

    Conteúdos Programáticos

    1. Introdução à Bioinformática. Definição. Evolução e árvore filogenética do mundo vivo. Macromoléculas e informática. Principais organizações de Bioinformática. 2. Bases de dados. Aspectos técnicos. Bases de dados principais. 3. Análise e comparação de sequências. Modelos de substituição de nucleótidos. Similaridade entre sequências. Métodos de comparação de sequências e distância evolutiva. Alinhamentos de sequências. Programas e noções de base. 4. Análise filogenética. Modelos de árvores filogenéticas. Métodos de construção de árvores. Testes estatísticos (Bootstrap) e programas. 5. Análise estrutural de macromoléculas. Evolução das proteínas. Previsão das estruturas. Classificação das proteínas. Determinação da estrutura das biomoléculas. Recursos e programas. 6. Genomas, proteomas, transcriptomas. Genomas (sequenciação, anotação, comparação, farmacogenética). Proteomas (electroforese bidimensional, espectrometria de massa). Transcriptomas (microarrays).
  • Objetivos

    Objetivos

    Competências a atingir: Manipulação dos principais bancos de dados biológicos e utilização de várias ferramentas oferecidas pela Bioinformática para o tratamento destes dados de natureza biológica.
  • Metodologias de ensino

    Metodologias de ensino

    O carácter essencialmente prático desta UC destina-se a desenvolver no estudante um saber fazer indispensável na sua futura carreira. Só a utilização repetida das principais técnicas propostas permitirá ao aluno atingir o domínio destas técnicas.
  • Bibliografia principal

    Bibliografia principal

    - Graur D. & Li W.-H. (2000). Fundamentals of molecular evolution. Sinauer, Sunderland. - Voet D. & Voet. J.G. (2010). Biochemistry, 4th Ed. John Wiley & Sons, New York.
  • Avaliação

    Avaliação

     

    Descrição

    Data limite

    Ponderação

    Frequências (2 provas mais uma 3º prova facultativa de recuperação)

    dd-mm-yyyy

    65%

    Assiduidade

    dd-mm-yyyy

    10%

    Trabalho de grupo

     

    25%

    Ensino presencial: Aulas teóricas magistrais com frequência voluntária seguindo o
    programa e de acordo com os objectivos da UC. Aulas teórico-práticas tutoradas por um docente, de
    frequência obrigatória destinadas a aplicar a dados reais as técnicas descritas.
    Requisitos para aproveitamento final:
    1) Avaliação contínua por 2 provas teórico-práticas (32,5% + 32,5%) + assiduidade 10% + projeto
    desenvolvido nas aulas práticas 25%; classificação total igual ou superior a 10 valores), com todos os
    documentos autorizados e com apoio informático.
    Ou 2) Exame teórico-prático no final do semestre (75%) + projeto desenvolvido nas aulas práticas 25%
    (classificação total igual ou superior a 10 valores), com todos os documentos autorizados e com apoio
    informático. Isenção de repetir uma das componentes em caso de nota igual ou superior a 9,5 valores
    obtida para esta componente em avaliação contínua ou exame final anterior.

    Presential teaching: Theoretical lectures of facultative attendance that follow the syllabus and
    respect the objectives of the CU. Theoretico-practical classes are mandatory classes under the guidance
    of a teacher and intended to practice techniques described in lectures with real data.
    Requirements to pass the discipline:
    1) Continuous evaluation by 2 midterm exams (32,5% + 32,5%) + class attendance 10% + project
    elaborated during the classes 25%; final classification equal or superior to 10), with all documents
    allowed and computer provided.
    Or
    2) Theoretico-practical exam by the end of the semester (75%) + project elaborated during the classes
    25% (classification equal or superior to 10), with all documents allowed and computer provided. Students
    with a minimum classification of 9,5 for a component at a previous evaluation (continuous evaluation or
    previous examination) are exempted from repeating it.

INSCRIÇÃO AVULSO
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