Desenvolve-se uma atividade de investigação sólida e dinâmica, com participação ativa em projetos de grande relevância (nacionais/internacionais) em temáticas atuais e estratégicas, como dispersão de poluentes em meios hídricos continentais e oceânicos, modelação de cheias, gestão sustentável dos recursos, energias renováveis, tratamento de águas e efluentes e alterações climáticas. A colaboração com instituições e centros de investigação de excelência, bem como o envolvimento em consórcios financiados por entidades como a FCT e a União Europeia, tem permitido consolidar redes de cooperação e reforçar o impacto científico dos trabalhos desenvolvidos.
Salienta-se ainda os serviços prestados à sociedade civil fazendo, os docentes, transferência de conhecimento e aplicando os seus conhecimentos quando solicitados; a integração dos alunos nos projectos, criando oportunidades únicas de participação em atividades de investigação aplicada, desenvolvimento de competências técnicas e científicas, e contacto direto com desafios reais do setor ambiental, o que contribui significativamente para a sua formação académica e profissional.